而对于朝鲜来说，正是这个仁祖，为了使自己区别于光海君才没有在明清两边搞平衡，否定光海君“不背明，不怒金”的政策，义无反顾地“亲明排金”。其实他根本就不是真心想要帮助明朝这个父亲之国，而是为了使自己看起来更有合法性。最终朝鲜正是因为没有采取光海君在明清两边的平衡外交而是“亲明排金”从而被洪太连打两次，几乎再次亡国。人口再一次暴跌，不足八百万了。
同时，全球气候导致的小冰河期使得朝鲜也大受影响，北方干旱，农田荒芜，粮食减产，人口无可增加。
朝鲜孱弱已经无力回天。战争摧残，人口减少，经济下滑，党争激烈，政变频繁，天灾不断，军备废弛，朝鲜看起来比照欧洲像是一个大国，其实已经如同西元十六世纪以后的波兰一般。
由于一系列天灾人祸，到了李存真入侵朝鲜的时候，朝鲜的国力其实已经越来越沦丧。经过孝宗励精图治，朝鲜国力有所提升，但是仍然聊胜于无，李棩极为更是昏聩无为。在南明和朝鲜重新确立了藩属关系之后，朝鲜的实力有所提升。但是这点提升几近于无。
面对经过改革且气势汹汹的清军，朝鲜毫无招架之力。洪承畴和范文程率领大军仅仅用了十五天就攻克了平壤和开城。然后清军迅速南下，十天之后就包围了汉城。
朝鲜国王李棩听说满清大军来了吓得魂不附体，赶快就如同当年的狗屁仁祖李倧一样赶快将自己的妻子儿女全都送去了江华岛，而他自己则带着大臣驻守在汉城以东的南汉山城上。
朝鲜的迅速败退使得驻朝明军措手不及。朝鲜甚至根本就没有把满清入侵的消息传递给明军。此时，南明明李政权的重臣柳河虽然在汉城，可是南明的密探却没有能够及时地通过赖塔等人拿到情报，就算拿到情报也根本不可能迅速传递给远在朝鲜的柳河。
情报延误，朝鲜孱弱。导致汉城地区的明军仓皇撤退，狼狈不堪。驻朝军队本来有两万多人，但是这些人此时都已经跟着三郑、关盛年和杨添秀等攻打山东登莱去了。留下的两千多人根本不可能是清军对手，无奈只能从京畿道退出。柳河希望经过忠清道至全罗道，然后在全罗道得到海军的接应退往济州岛。
驻朝明军一枪未放就南逃，使得朝鲜君臣和朝鲜军队信心动摇。此时朝鲜有三路勤王兵马已经赶到，冬天严寒且朝鲜军队装备了火枪，给了清军不小的杀伤。但是清军人多势众，火炮众多，朝军几番作战都十分不利，而且人数也只有不足六万人。最终被清军的大炮炸翻了天。申浏和边茂率领一千朝军火枪手竟然沿着柳河逃跑的道路一路南逃而去。
康熙四年正月初五，洪承畴下令攻打南汉山城。战斗仅仅持续了一个上午。眼看着山城就要被攻克，城内竖起了降旗。
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